組織架構
第一層：處長
第二層：
副處長：農林科、漁牧科、工商及投資發展科、青創及產業輔導科
第三層：
農林科：林務所、農試所、縣農會
漁牧科：畜試所、防疫所、水試所、區漁會
工商及投資發展科：金門縣陶瓷廠、金門縣工商發展策進會、金門縣中小企業服務中心、縣工業會、縣商業會
青創及產業輔導科：
